萨迦寺是藏传佛教萨迦派主寺，由萨迦派创始人昆贡却杰布于公元1073年始建。分南北两寺，以仲曲河为界，北寺位于北岸的苯波山前，曾遭受了巨大的损毁。现在看到的萨迦寺是南寺。寺中珍品浩瀚，文物繁多，尤以元代的壁画很有特色。

萨迦寺不仅建筑宏大精美，寺内还藏有大量颇具艺术价值的文物，如印章、典籍、佛像等，大量藏书都是元朝遗传下来，很多是珍贵的珍本和孤本。萨迦寺有四件珍奇的宝物，即贡布古如（由竹青白瓦巴从印度请来的依怙神像）、朗结曲丹（由大译师帕白洛扎瓦修建的佛塔，塔里经常出水，被视为神水）、文殊菩萨像（系萨班的本尊像，据说在像前念七天文殊经就能打开智慧之门）、玉卡姆度母像（八思巴供奉的本尊佛像），四大奇宝中三件是佛像。

萨迦寺有各种精美壁画3000多幅，题材广泛，涉及宗教、历史、文化和社会生活等方面，以佛经、教义、神话传说、历史故事、昆氏史、萨迦史、山水景观、花卉瑞兽、装饰图案等为主，场面宏大，内容丰富。